Après les enseignements d'initiation et de spécialisation du premier cycle, les deux années du DNSEP sont consacrées au projet artistique de l'élève et à la préparation d'un mémoire de fin d'études en relation avec le projet. L'élève développe les compétences théoriques, techniques et pratiques acquises en DNA.
Il reçoit des enseignements de méthodologie de projet, d'initiation à la recherche, d'environnement professionnel complétés par des séminaires et des ateliers optionnels.
Les enseignements suivis sont variables selon la mention choisie dès le premier cycle et sont propres à chaque établissement : en DNSEP design, il est possible, par exemple, de choisir des spécialisations en design industriel, design textile, design graphique, design d'objet, design d'espace, design culinaire, création numérique, etc.
Un semestre peut être effectué dans une école d'art à l'étranger ou consacré à un stage en agence ou dans un bureau de création.
L'option design du DNSEP vise à développer les capacités et les compétences de recherche et de développement dans les projets de création design.